Что-то вроде ...
<?php
// you'll need to include /modules/comment/comment.admin.inc
module_load_include('inc', 'comment', 'comment.admin');
// I'm assuming you have access to the cid, the unique
// identifier for comments stored in the {comments} table
$comment = _comment_load($cid);
_comment_delete_thread($comment);
_comment_update_node_statistics($comment->nid);
?>
Это решение для Drupal 6, но вы можете позаимствовать включаемые файлы из модуля комментариев и перехватить их функции в других версиях.
Я не уверен, что модули contrib, расширяющие базовую функциональность форума (например, Advanced Forum ), предоставляют опцию без написания пользовательского кода, но вы, возможно, захотите изучить ее.