Это на самом деле не так, как SVN должен работать. Изменения в структурах каталогов, файлах и т. Д., Содержащихся в SVN, должны выполняться через IDE или другое приложение, поддерживающее SVN, а не в самой файловой системе (т. Е. Через проводник Windows).
SVN фактически отслеживает изменения в своей файловой системе, и когда вы работаете с SVN-контроллером, вы заставляете все это не синхронизироваться.