Нужна помощь в установке пакета VGAM для R 3.3.3 - PullRequest
Новая
       72

Нужна помощь в установке пакета VGAM для R 3.3.3

0 голосов
/ 19 мая 2019

Невозможно сделать три ранее описанных способа ручной установки старого пакета (VGAM) для старой версии R (v3.3.3) для работы на платформе: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-разрядная версия)

Предыдущие темы на эту тему, из которых я пытался извлечь:

Загрузка и установка пакетов вручную в R

"установка пакета" FILE_PATH«имел ненулевой статус выхода» в R

Я использую Mac OS 10.9.5, поэтому мне нужно запустить R v3.3.3.Поэтому я не могу загрузить текущую версию пакета VGAM, поэтому я пытался и не смог установить предыдущие версии этого, играя с приведенным ниже кодом, но все три попытки приводят к ненулевому состоянию выхода.Похоже, что есть проблемы с gfortran?Не уверен, что это такое или что он делает. 

install.packages('VGAM_1.0-2.tar.gz', lib = "/Users/benny/Google Drive/SEDGWICK PROJECT GRANIVORES/R", repos = NULL, dependencies = TRUE)

download.file('https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/VGAM/VGAM_1.0-0.tar.gz', 
              f <- tempfile())
untar(f, exdir=tempdir())
file.copy(file.path(tempdir(), '.RData'), 'VGAM.RData')
# the above copies the .RData file to a file called VGAM.RData in your current 
# working directory.
load('VGAM.RData')

download.file('https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/VGAM/VGAM_1.0-0.tar.gz',
              f <- tempfile())
untar(f, exdir=tempdir())
load(file.path(tempdir(), '.RData'))

Я ожидаю успешной установки пакета VGAM, но я получаю следующие сообщения об ошибках для каждого фрагмента кода соответственно: 

>* installing *source* package ‘VGAM’ ...
** package ‘VGAM’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
clang -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG  -I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include    -fPIC  -Wall -mtune=core2 -g -O2  -c caqo3.c -o caqo3.o
gfortran-4.8   -fPIC  -g -O2  -c cqof.f -o cqof.o
make: gfortran-4.8: No such file or directory
make: *** [cqof.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘VGAM’
* removing ‘/Users/benny/Google Drive/SEDGWICK PROJECT GRANIVORES/R/VGAM’
* restoring previous ‘/Users/benny/Google Drive/SEDGWICK PROJECT GRANIVORES/R/VGAM’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘VGAM_1.0-2.tar.gz’ had non-zero exit status

Для второго фрагмента / попытки метод file.copy () просто выводит «FALSE» и, похоже, не создает файл «VGAM.RData» должным образом, как я хочу: 

[1] FALSE

> load('VGAM.RData')

cannot open compressed file 'VGAM.RData', probable reason 'No such file or directory'
Error in readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) : cannot open the connection

Третий блок / попытка возвращает следующую ошибку: 

cannot open compressed file '/var/folders/03/9d3s2ktx79l_wm7n2w9vmcdh0000gn/T//Rtmpdb04UI/.RData', probable reason 'No such file or directory'
Error in readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) : cannot open the connection
...