Пользователь2 не имеет разрешения на запись в /ibm/WebSphere/AppServer/profiles/AppSrv02/config/wstemp.
Вам нужно разрешить пользователю user2 писать в этот каталог и подкаталоги.
Кроме того, сценарий может завершиться ошибкой, так как user2 не имеет разрешений на настройку OSGI. Если это так, вам нужно установить системное свойство для wsadmin:
/ibm/WebSphere/AppServer/profiles/AppSrv02/bin/wsadmin.sh -lang jython -javaoption "-Dosgi.configuration.area=/home/user2/.eclipse" ...
Следует отметить, что IBM предполагает, что wsadmin.sh всегда будет запускаться как пользователь установки, в данном случае user1. Официальный поддерживаемый способ сделать то, что вы хотите, это установить «административный клиент» в качестве пользователя2 либо на этом сервере, либо на другом сервере. (а затем укажите хост и порт мыла) Это позволит избежать проблем с разрешениями.