Использование областей атласа мозга nifti для ROI с Marsbar - PullRequest
0 голосов
/ 02 июня 2019

Я хочу использовать ROI, определенные в вероятностных картах, разработанные Hammers et al. (находится здесь http://brain -development.org / атласы мозга / атласы взрослых-взрослых / ). Поскольку эти регионы доступны в формате nifti, а для панели инструментов SPM Marsbar требуется формат .mat, я решил попробовать преобразовать файлы в .mat. Я сделал это, но все еще не могу использовать файл .mat для анализа MarsBar.

Я попытался преобразовать один из файлов region.nii, используя функцию «load_nii» инструментов Nifti (описано в этой теме: Как перенести файл Nifti в файл Matlab .mat? ). Как описано в связанном треде, я просто сохранил загруженную переменную («ans») в виде файла .mat.

Однако, если я затем перехожу к Marsbar и пытаюсь "просмотреть" (из первого выпадающего меню), я получаю это: Предупреждение: ROI 1 отсутствует

In mars_display_roi (строка 76) В спм (строка 1063)

Я действительно не уверен, что происходит не так. Не достаточно ли информации на изображении nifti для создания карты .mat, которая нужна MarsBar?

Прошу прощения, если это очень простые вопросы.

Большое спасибо заранее, Loren

...