При запуске следующего кода с библиотекой include rgdal на Redhat я получаю неверный результат.Конкретно, inner_join, кажется, копирует каждую строку первого фрейма данных без учета ключей второго фрейма данных (следовательно, просто копирует вместо объединения).
Это минимальный пример выполнения, извлеченный из гораздо большего кодав интерактивном веб-приложении (r-блестящий).Там мои исходные фреймы данных имеют тысячи строк.Помимо неверного результата, соединение также будет превышать память.
Я пробовал несколько версий Linux Distros и R.Вот конфигурация, где я получаю эту ошибку: Red Hat Enterprise Linux Server версии 7.6 (Maipo) R версии 3.5.2 (из EPEL) или 3.6.0 (скомпилировано с нуля)
> sessionInfo()
R version 3.6.0 (2019-04-26)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Red Hat Enterprise Linux Server 7.6 (Maipo)
Matrix products: default
BLAS: /opt/R/3.6.0/lib64/R/lib/libRblas.so
LAPACK: /opt/R/3.6.0/lib64/R/lib/libRlapack.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=de_CH.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=de_CH.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=de_CH.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=de_CH.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] rgdal_1.4-4 sp_1.3-1 bit64_0.9-7 bit_1.1-14 dplyr_0.8.1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_1.0.1 lattice_0.20-38 crayon_1.3.4 assertthat_0.2.1
[5] grid_3.6.0 R6_2.4.0 magrittr_1.5 pillar_1.4.1
[9] rlang_0.3.4 glue_1.3.1 purrr_0.3.2 compiler_3.6.0
[13] pkgconfig_2.0.2 tidyselect_0.2.5 tibble_2.1.2
Ошибка делаетне происходит в Ubuntu 18.04.2 LTS, ни с версией R 3.6.0, ни с версией R 3.4.4.
Вот код:
library(dplyr)
library(bit64)
library(rgdal) # Bug only when including this package
df1 <- data.frame( a=c(1,2,3), id=as.integer64(c(10,11,12)) )
df2 <- data.frame( id=as.integer64(c(13,14)), b=c(4,5) )
print( df1 )
print( df2 )
# Bug
print( nrow( df1 ) ) # 3
t <- inner_join( df1, df2, by="id" )
print( nrow( t ) ) # correct would be 0, but returns 6!
Результат:
> t
a id b
1 1 10 4
2 1 10 5
3 2 11 4
4 2 11 5
5 3 12 4
6 3 12 5
Правильно было бы:
> t
[1] a id b
<0 rows> (or 0-length row.names)
Учитывая разные результаты на разных дистрибутивах Linux (но с одинаковыми версиями и библиотеками R), я бы предположил, что ошибка связана с базовыми библиотеками, используемыми в дистрибутиве RedHat,Я был бы очень признателен за любые предложения или указания о том, как решить эту проблему.