«Нулевой статус выхода» R 3.6.0 «Биобаза» - PullRequest
3 голосов
/ 21 мая 2019

Мне нужно установить разные пакеты на R. ОС - это Ubuntu для Windows.Когда я пытаюсь "BiocManager :: install (" Biobase "), я получаю следующую ошибку:

** R
** data
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** checking absolute paths in shared objects and dynamic libraries
mv: cannot move '/home/mark/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/00LOCK-Biobase/00new/Biobase' to '/home/mark/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/Biobase': Permission denied
ERROR:   moving to final location failed

Кажется, что-то не так с разрешением перемещать определенные файлы .. Я уже пытался дать разрешение на записьдля всех в каталоге /3.6, это ничего не изменило.

Какие-нибудь решения?

1 Ответ

8 голосов
/ 29 мая 2019

Видимо, это новая функция в 3.6. Но это должно решить вашу проблему:

Sys.setenv(R_INSTALL_STAGED = FALSE)

...