Ввод-вывод Скрытая реализация модели Маркова в Python - PullRequest
0 голосов
/ 18 июня 2019

Я пытаюсь реализовать скрытые марковские модели с архитектурой ввода-вывода, но я не могу найти ни одной хорошей реализации для того же Python.

Может кто-нибудь поделиться пакетом Python, который мог бы рассмотреть следующую реализацию для HMM.

Разрешить непрерывные выбросы.Разрешить функциональность ковариат (т.е. независимых переменных в I / O HMM).

В данный момент я изо всех сил пытаюсь найти реализацию Python для того же.

Я не смог найти соответствующие примерыв hmmlearn.

Вот несколько библиотек, которые я протестировал:

hmmlearn: hmmlearn позволяет передавать несколько объектов в выбросы / наблюдения, но не обеспечивает поддержку включения ко-вариаций(т.е. независимые переменные).

hmms: не поддерживает функции добавления непрерывных выбросов, а также не поддерживает добавление независимых переменных.

IOHMM: я смог обучить модель HMM с использованием этой библиотеки, но могне могу найти документацию для прогнозирования после обучения модели.

Поэтому я ищу пакет, который служит цели.

from IOHMM import UnSupervisedIOHMM
from IOHMM import OLS, DiscreteMNL, CrossEntropyMNL, forward_backward

SHMM = UnSupervisedIOHMM(num_states=3, max_EM_iter=200, EM_tol=1e-6)

SHMM.set_models(model_emissions = [OLS(est_stderr=True)], 
                model_transition=CrossEntropyMNL(solver='lbfgs'),
                model_initial=CrossEntropyMNL(solver='lbfgs'))

SHMM.set_inputs(covariates_initial = [], covariates_transition = [], covariates_emissions = [['Insulin']])


SHMM.set_outputs([['Glucose']])

SHMM.set_data([data])

SHMM.train() 

Я не мог понять, как получить вероятности выбросови последовательность скрытых состояний после вышеуказанной тренировки.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...