В моем университете есть Linux-машина с мощным Jupyter, работающим в кампусе. Вот шаги, которые я использую для входа на удаленный сервер через мой ноутбук с Windows и запуска ноутбука Jupyter на сервере, который можно редактировать в моем локальном браузере через туннелирование ssh, но он всегда выдает мне ту же ошибку:
- Установка anaconda и Jupyter на удаленный сервер
- Создайте свое окружение и активируйте его
Для туннелирования SSH, вот как я подключаюсь к удаленному серверу на CMD:
Ssh –L 8000(on my laptop):localhost:8889(on remote server) <MyUserID>@<RemoteServerIP>
После этого он запрашивает мой пароль, и я вхожу на удаленный сервер
Чтобы активировать анаконду, я использую следующую команду:
source $HOME/anaconda3/bin/activate
После входа в анаконду я активирую свою среду:
conda activate <env_name>
После входа в среду, чтобы запустить ноутбук Jupyter, я набираю:
jupyter notebook
или
jupyter notebook --no-browser --port=8889
Затем отображается:
[I 09:04:06.122 NotebookApp] Writing notebook server cookie secret to /run/user/148037468/jupyter/notebook_cookie_secret
[I 09:04:06.881 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: <directoryname>
[I 09:04:06.881 NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at:
[I 09:04:06.881 NotebookApp] http://localhost:8889/
[I 09:04:06.881 NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).
[I 09:05:10.507 NotebookApp] 302 GET / (::1) 1.43ms
Затем на своем ноутбуке я набираю:
localhost:8000
Он перенаправляет меня на страницу входа, где я успешно вижу свой каталог в блокноте jupyter и нажимаю на файл .ipynb
После этого шага он никогда не загружает ноутбук и отображает следующую ошибку на ноутбуке:
Не удалось установить соединение с сервером ноутбука. Ноутбук продолжит пытаться восстановить соединение. Проверьте сетевое подключение или конфигурацию сервера ноутбука.
На терминале выдается следующая ошибка:
The signatures database cannot be opened; maybe it is corrupted or encrypted. You may need to rerun your notebooks to ensure that they are trusted to run Javascript. The old signatures database has been renamed to <directory_name>.local/share/jupyter/nbsignatures.db.bak and a new one has been created.
[W 09:17:35.807 NotebookApp] Failed commiting signatures database to disk.
You may need to move the database file to a non-networked file system, using config option `NotebookNotary.db_file`. Using in-memory signatures database for the remainder of this session.
[W 09:17:35.811 NotebookApp] Notebook plots1.ipynb is not trusted
[W 09:17:35.881 NotebookApp] 404 GET /nbextensions/widgets/notebook/js/extension.js?v=20190319090406 (::1) 17.39ms referer=http://localhost:8000/notebooks/plots1.ipynb
[I 09:17:36.430 NotebookApp] Kernel started: 242b529a-5acd-4b5f-8a6d-356947ab30d2
[W 09:18:36.467 NotebookApp] Timeout waiting for kernel_info reply from 242b529a-5acd-4b5f-8a6d-356947ab30d2
/<directory_name>/anaconda3/envs/braingrid/lib/python3.6/site-packages/notebook/base/zmqhandlers.py:284: RuntimeWarning: coroutine 'WebSocketHandler.get' was never awaited
super(AuthenticatedZMQStreamHandler, self).get(*args, **kwargs)
[W 09:18:38.276 NotebookApp] Replacing stale connection: 242b529a-5acd-4b5f-8a6d-356947ab30d2:dd09ca5465ba404a886c71b3ca787d6b
[W 09:21:36.370 NotebookApp] Notebook plots1.ipynb is not trusted
[IPKernelApp] ERROR | Failed to open SQLite history /<directory_name>/.ipython/profile_default/history.sqlite (database is locked).
[IPKernelApp] ERROR | History file was moved to /<directory_name>/.ipython/profile_default/history-corrupt.sqlite and a new file created.
И ноутбук Jupyter продолжает отображать:
"Connecting to terminal"
Я не знаю, как это исправить. Я новичок в Linux. Ни одна из команд sudo не работает, так как я не являюсь администратором / или не обладаю этими привилегиями
Эта настройка необходима для моей диссертации.