Проверьте ваши операторы создания таблицы в экспортированном файле. Может быть, где-то в вашем состоянии создания определены два первичных ключа.
Таблица может иметь только один первичный ключ, который может состоять из одного или нескольких полей. Когда несколько полей используются в качестве первичного ключа, они называются составным ключом.
Если возможно, создайте базу данных и таблицы вручную и удалите операторы создания таблиц из файла expoted, и вы можете получать только данные из файла.