Вы можете использовать любую AMD-совместимую библиотеку в SuiteScript, загрузив исходный файл в File Cabinet и включив его в качестве зависимости в свой модуль скрипта. Пока EJS предоставляет AMD-совместимый формат, у вас не должно возникнуть проблем с добавлением его в сценарий.
Помните, что весь SuiteScript на стороне сервера работает на Rhino, который поддерживает только ECMA 5.1, поэтому, если библиотека содержит набор ES6 +, она будет работать только на стороне клиента и, скорее всего, выдаст ошибку на стороне сервера.