Как решить или подавить стену предупреждений, используя любой код pystan - PullRequest
Новая
       28

Как решить или подавить стену предупреждений, используя любой код pystan

0 голосов
/ 02 апреля 2019

Когда я запускаю любой код pystan, я получаю то, что ожидаю, но я получаю стену предупреждений.

Я попытался обновить pystan и cython, так как они упоминаются в стене предупреждений. У меня теперь pystan версии 2.17.1 и cython 0.29.2. Я использую python3.7. 

import pystan
model_code = 'parameters {real y;} model {y ~ normal(0,1);}'
model = pystan.StanModel(model_code=model_code)  # this will take a minute
y = model.sampling(n_jobs=1).extract()['y']
y.mean()  # should be close to 0

Полученное сообщение об ошибке начинается с: 

/home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/Cython/Compiler/Main.py:367: FutureWarning: Cython directive 'language_level' not set, using 2 for now (Py2). This will change in a later release! File: /tmp/tmp8_plkepg/stanfit4anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf_5335140894361802645.pyx
  tree = Parsing.p_module(s, pxd, full_module_name)
cc1plus: warning: command line option ‘-Wstrict-prototypes’ is valid for C/ObjC but not for C++
In file included from /home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1823:0,
                 from /home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:18,
                 from /home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4,
                 from /tmp/tmp8_plkepg/stanfit4anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf_5335140894361802645.cpp:688:
/home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:15:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " "#defining NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp]
 #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " \
  ^~~~~~~
In file included from /home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/pystan/stan/lib/stan_math/lib/boost_1.66.0/boost/numeric/ublas/matrix.hpp:19:0,
                 from /home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/pystan/stan/lib/stan_math/lib/boost_1.66.0/boost/numeric/odeint/util/ublas_wrapper.hpp:24,
                 from /home/femke/anaconda3/lib/python3.7/site-packages

Это о чем беспокоиться? Если нет, то как конкретно отключить эти предупреждения, но не из других частей моего кода? Если так, что я должен изменить.

Редактировать : после прочтения вопроса Предупреждение Cython Numpy о NPY_NO_DEPRECATED_API при использовании MemoryView , я до сих пор не знаю, как безопасно отключить это предупреждение.

...