Вы можете переместить ваш временный каталог в другую папку (вне временной папки win10), например, с помощью write("TMP = '<your-desired-tempdir>'", file=file.path(Sys.getenv('R_USER'), '.Renviron'))
Если он все еще удаляется, то маловероятно, что Win10 удалит его.
редактирование с помощью OP
В зависимости от [чего-то загадочного], та же самая команда выше должна использоваться для создания TEMP
и TMPDIR
, как обсуждено здесь