Я был там, мне потребовалось некоторое время, пока я полностью не понял, как работают настройки Sublime и что их изменяют.
Общее предложение, которое может помочь с этой проблемой (и многие другие, с которыми вы можете столкнуться во время работыс возвышенным):
Прочитайте эту страницу внимательно, особенно НАСТРОЙКИ ФАЙЛОВ раздел, обратите особое внимание на иерархию файлов prefs.
Для меня это было истинным откровением, которое поставило вопрос прямо навсегда.
Надеюсь, вам это тоже поможет