Два разных набора парных данных обычно имеют ненулевое среднее значение различий. Вопрос в том, является ли эта разница "существенной". Вопрос, на который отвечают t-тесты, состоит в том, насколько вероятны эти значения из наборов данных без различий. Значение p, близкое к нулю, говорит о том, что крайне маловероятно, что нет никакой разницы (в предположениях теста, который обычно представляет собой нормальное распределение ошибок.
Парные t-тесты строятся не с раздельным вычислением средних значений двух наборов данных, а с анализом парных различий, поэтому он действительно рассматривает только одно среднее и сравнивает его с ожидаемым «нулевым результатом», равным нулю.
Вы хотели бы знать, есть ли на самом деле разница, но на самом деле это не то, что говорит вам тест. Вместо этого он говорит вам, насколько вероятно, что данные могут возникнуть из ситуации, когда ожидаемая разница была равна нулю. Это то, что дает обычная «частичная» статистика. Альтернативная байесовская перспектива пытается дать оценку вероятной разницы, учитывая данные.