OpenCV не предлагает функцию прямого подсчета пикселей черного цвета, но функцию подсчета всех пикселей, отличных от черного: cv2.countNonZero (img)
Поскольку вы не разместили свой код, вот пример, как вы могли бы использовать это:
# get all non black Pixels
cntNotBlack = cv2.countNonZero(img)
# get pixel count of image
height, width, channels = img.shape
cntPixels = height*width
# compute all black pixels
cntBlack = cntPixels - cntNotBlack
Обратите внимание, что при этом будет найден только черный пиксель (то есть все каналы равны нулю).