Убедитесь, что файлы конфигурации во всех ваших проектах, которым требуется доступ к базе данных, указывают на один и тот же файл.Если вы только что использовали значение из статьи
"Default": "Data Source=SqliteDemoDb.db"
, то у вас есть отдельный файл базы данных в каждом проекте.Файл, для которого выполняются миграции, находится в проекте EntityFramework.