У меня есть несколько запросов, связанных с множественной коррекцией.
Я провел многомерный анализ Кокса на выживаемость и получил значение p для каждого сайта cpG. Теперь я хочу исправить эти необработанные значения p, используя p.adjust в R. При этом скорректированные значения p_values остались такими же, как и для необработанных значений p, независимо от используемого мной метода.
Почему я получаю одинаковые значения, кто-нибудь может объяснить. Как я могу исправить это, если я делаю это неправильно?
Если я хочу установить количество сравнений (n) для 480000 зондов, как мне это решить?
Любая помощь будет оценена.
Спасибо
p_adjust <- p.adjust(p_value, method="fdr")