Не ясно, спрашиваете ли вы, как найти x-координаты, при которых ваша совокупная линия распределения достигает 0,1, 0,5, 0,9 (сложно сделать, поэтому я пока оставлю это), или спрашиваете, как нарисовать линии один раз Вы знаете эти значения х. Последняя часть проста. Подумайте о линиях, которые вы хотите нарисовать, как незакрепленную часть прямоугольника, которая выходит за пределы графика внизу справа:
set object 1 rectangle from x1, 0.1 to graph 2, -2 fillstyle empty border lc "blue"
set object 2 rectangle from x2, 0.1 to graph 2, -2 fillstyle empty border lc "green"
set object 3 rectangle from x3, 0.1 to graph 2, -2 fillstyle empty border lc "red"
plot ...