Внешний прямоугольник на самом деле является неотъемлемой частью диаграммы Венна (он представляет собой универсальный набор).Вот почему пакет не предлагает опцию опустить его.Если вы хотите удалить его, грязный хак может перезаписать его другим блоком в цвете фона.
venn(6, zcolor = 'style', opacity = 0.3, cexil = 0.8, cexsn = 1, frame=F)
zeroset <- matrix(1000*c(0,1,1,0,0,0,0,1,1,0), ncol = 2)
lines(zeroset, col='white', lwd=5)