Visual Studio просто пытается разместить все ваши файлы в одном месте, а остальные - в папке проекта.
Q1 - База данных SQL Ce может быть где угодно, вы используете раздел настроек ConnectionStrings в вашем app.settings. SQL Ce - это просто файл, не более, не менее, поэтому доступный из любого приложения. Он не скомпилирован в ваше приложение, он просто путешествует с ним при развертывании и т. Д.
Чтобы ответить на вопрос 2 - вы, вероятно, можете, но я не уверен, что он будет работать автоматически для вас.
Q3 - читать из ftp, вероятно, нет, если вы не включили поддержку ftp-клиента в свое приложение и не загрузили его в фоновом режиме. Другим решением будет сопоставление ftp локальному диску и доступ к нему оттуда.
Например, сохранение строки подключения в app.config (отрывок из app.config):
<connectionStrings>
<add name="db" connectionString="Provider=Microsoft.SQLSERVER.OLEDB.CE.2.0; data source=c:SomePathToSDFfile" />
</connectionStrings>
Позже в вашем приложении вы получаете доступ к этой строке подключения следующим образом:
(добавить ссылку на System.Configuration)
Dim c As Configuration.ConnectionStringSettingsCollection
Dim cn As SqlClient.SqlConnection
c = Configuration.ConfigurationManager.ConnectionStrings
cn = New SqlClient.SqlConnection
cn.ConnectionString = c.Item("db").ConnectionString
cn.Open()