Пакет RStem был удален из репозитория CRAN.Вы можете скачать с помощью следующей команды: -
install.packages('Rstem', repos = "http://www.omegahat.net/R")
Убедитесь, что на вашем компьютере установлен RTools.Вы можете скачать его по этой ссылке -
Building R для Windows