Построение тепловых карт под каплями на точечной диаграмме с помощью matplotlib - PullRequest
0 голосов
/ 16 мая 2019

У меня есть матрица Nx2 X и N-тусклый вектор меток y.Например:

from sklearn.datasets.samples_generator import make_blobs
import matplotlib.pyplot as plt

X, y = make_blobs(n_samples=100, centers=2, n_features=2, random_state=2)

plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=y, edgecolor='k')
plt.show()

enter image description here

На фоне этого графика я хочу построить две тепловые карты с цветовой картой, в которой цвет точки отображается назоны с высокой плотностью точек, так что изображение выглядит как фиолетовое и желтое облако, каждое из которых сосредоточено на фиолетовых и желтых каплях.

Это было непросто для меня.Я попытался создать двухмерную гистограмму для каждого большого двоичного объекта, как показано в этом ответе, а также создал собственную цветовую карту, чтобы области с низкой плотностью на графике были белыми, а области с высокой плотностью окрашивались в цвет этого большого объекта.:

import numpy as np
import seaborn as sns
from matplotlib.colors import ListedColormap

palette_colors = sns.color_palette("deep")
palette = sns.light_palette(palette_colors[0], input="husl", n_colors=100)
my_cmap = ListedColormap(sns.color_palette(palette).as_hex())

whr1 = np.where(y==0)
whr2 = np.where(y==1)
x1 = X[whr1][:, 0]
y1 = X[whr1][:, 1]
x2 = X[whr2][:, 0]
y2 = X[whr2][:, 1]

heatmap1, xedges1, yedges1 = np.histogram2d(x1, y1, bins=50)
extent1 = [xedges1[0], xedges1[-1], yedges1[0], yedges1[-1]]
heatmap2, xedges2, yedges2 = np.histogram2d(x2, y2, bins=50)
extent2 = [xedges2[0], xedges2[-1], yedges2[0], yedges2[-1]]

Но сейчас я не знаю, как построить эти тепловые карты с помощью imshow.Я также хочу удостовериться, что, если капли перекрываются, то будут и тепловые карты, так что одна тепловая карта не покрывает другую тепловую карту, а скорее будет комбинация цветов и интенсивностей тепловых карт в перекрывающейся области.

Я очень ценю вашу помощь!

1 Ответ

1 голос
/ 16 мая 2019

Вы можете использовать Kdeplot Seaborn

x1,y1 = np.random.normal(loc=0.0, scale=1.0, size=(100,)), np.random.normal(loc=2.0, scale=1.0, size=(100,))
x2,y2 = np.random.normal(loc=2., scale=1.0, size=(100,)), np.random.normal(loc=0.0, scale=1.0, size=(100,))

fig, ax = plt.subplots()
sns.kdeplot(x1,y1, shade=True, shade_lowest=False, alpha=0.5, cbar=False, ax=ax, cmap="Blues")
sns.kdeplot(x2,y2, shade=True, shade_lowest=False, alpha=0.5, cbar=False, ax=ax, cmap="Oranges")
ax.scatter(x1,y1, color="C0")
ax.scatter(x2,y2, color="C1")

enter image description here

...