Как найти, какие элементы, связанные с какими частями диаграммы Венна, используя функцию calc.overlap в r? - PullRequest
Новая
       47

Как найти, какие элементы, связанные с какими частями диаграммы Венна, используя функцию calc.overlap в r?

0 голосов
/ 07 апреля 2019

Выходная информация для Calculate.overlap не ясна.Есть несколько имен для каждой позиции диаграммы Венна, такие как: $ a1, $ a2, ... Это становится настолько сложным, когда мы рисуем его для пяти списков.Как распознать, какие имена ($ a1, $ a2, ...) связаны с перекрытием каких списков? 

library(VennDiagram)

overlap=calculate.overlap(
    x=list(
        "A"=c("a","b","c"),
        "B"=c("a","b","c","d"),
        "C"=c("a","c","d")
    )
)

и это вывод: 

$a5
[1] "a" "c"

$a2
[1] "b"

$a4
character(0)

$a6
[1] "d"

$a1
character(0)

$a3
character(0)

$a7
character(0)

Какзаменить эти имена именами из моего списка?

Мой ожидаемый результат: 

$A,B,C
[1] "a" "c"

$A,B
[1] "b"

$A,C
character(0)

$B,C
[1] "d"

$A
character(0)

$B
character(0)

$C
character(0)

1 Ответ

1 голос
/ 09 апреля 2019

Ответ здесь .Однако я не претендую на это.Общее правило для упорядочения областей на диаграмме Венна заключается в использовании ее двоичного представления.Мой пакет nVennR использует это представление и может дать вам быстрый ответ на любое количество наборов: 

> library(nVennR)
> myV <- plotVenn(list("A"=c("a","b","c"), "B"=c("a","b","c","d"), "C"=c("a","c","d")), showPlot = F)
> listVennRegions(myV)
$`0, 1, 1 (B, C)`
[1] "d"

$`1, 1, 0 (A, B)`
[1] "b"

$`1, 1, 1 (A, B, C)`
[1] "a" "c"

> listVennRegions(myV, na.rm = F)
$`0, 0, 0 ()`
[1] NA

$`0, 0, 1 (C)`
[1] NA

$`0, 1, 0 (B)`
[1] NA

$`0, 1, 1 (B, C)`
[1] "d"

$`1, 0, 0 (A)`
[1] NA

$`1, 0, 1 (A, C)`
[1] NA

$`1, 1, 0 (A, B)`
[1] "b"

$`1, 1, 1 (A, B, C)`
[1] "a" "c"

Существует виньетка с более подробной информацией об использовании.

...