AjaxUpload - классная библиотека, но она не удобна для пользователя, я думаю, что стандартный метод ajax на данный момент является лучшим решением,
я могу предложить создать один глобальный java-скрипт или класс Jquery для всех запросов ajax вваш проект и все запросы отправляются из этого класса, а все ответы обрабатываются в этом классе)