Добавьте 95% доверительные интервалы в качестве столбцов ошибок к графику панд - PullRequest
1 голос
/ 26 июня 2019

Я хочу добавить полосы ошибок 95% доверительного интервала к графику панд, как здесь .Вот как выглядят мои данные:

ciRatings.head(20)

                            count   mean        std
condition   envCond         
c01         CSNoisyLvl1     40      4.875000    0.404304
            CSNoisyLvl2     40      4.850000    0.361620
            LabNoisyLvl1    52      4.826923    0.382005
            LabNoisyLvl2    52      4.826923    0.430283
            LabQuiet        92      4.826087    0.408930
c02         CSNoisyLvl1     40      2.825000    0.902631
            CSNoisyLvl2     40      3.000000    0.816497
            LabNoisyLvl1    52      3.250000    1.218726
            LabNoisyLvl2    52      3.096154    1.089335
            LabQuiet        92      2.956522    1.036828
c03         CSNoisyLvl1     40      3.750000    0.669864
            CSNoisyLvl2     40      3.775000    0.659740
            LabNoisyLvl1    52      4.307692    0.728643
            LabNoisyLvl2    52      4.288462    0.723188
            LabQuiet        92      3.967391    0.790758
c06         CSNoisyLvl1     40      4.450000    0.638508
            CSNoisyLvl2     40      4.250000    0.669864
            LabNoisyLvl1    52      4.692308    0.578655
            LabNoisyLvl2    52      4.384615    0.599145
            LabQuiet        92      4.717391    0.452735

Я просмотрел документацию для панд о том, как использовать панели ошибок, и попытался скопировать их кодпример.Я придумал следующее:

# calculate range of CI around mean (as it is symmetric)
ci95_lower = []

for i in ciRatings.index:
    count, mean, std = ciRatings.loc[i]
    ci95_lower.append(mean - 1.96*std/math.sqrt(count))

ciRatings['CI95_lower'] = ci95_lower
ciRatings['CI95_range'] = ciRatings['mean'] - ciRatings['CI95_lower']

# extract CI range and means
ciRange = ciRatings[['CI95_range']]
ciRange = ciRange.unstack()
ciRatings = ciRatings[['mean']]

# bar plot with CI95 as error lines
ciBarPlot = ciRatings.unstack().plot(kind='bar', yerr=ciRange, capsize=4)

plt.show()

Однако это приводит к приведенному ниже графику, явно без ошибок.В чем была моя ошибка?Я предполагаю, что неправильно понял, что именно я должен передать функцию plot в качестве аргумента yerr.

bar plot

Редактировать: Используя ответ Куанга Хоанга, яизменил мой код следующим образом для достижения желаемых доверительных интервалов:

# calculate range of CI around mean (as it is symmetric)
ci95_lower = []

for i in ciRatings.index:
    count, mean, std = ciRatings.loc[i]
    ci95_lower.append(mean - 1.96*std/math.sqrt(count))

ciRatings['CI95_lower'] = ci95_lower
ciRatings['CI95_range'] = ciRatings['mean'] - ciRatings['CI95_lower']

# bar plot with CI95 lines
ciBarPlot = ciRatings['mean'].unstack(level=1).plot.bar(
            yerr=ciRatings['CI95_range'].unstack(level=1), capsize=4)

plt.show()

1 Ответ

1 голос
/ 26 июня 2019

Данная ссылка предлагает:

fig, ax = plt.subplots(figsize=(12,8))
(df['mean'].unstack(level=1)
           .plot.bar(yerr=df['std'].unstack(level=1) * 1.96,
                     ax=ax, capsize=4)
)
plt.show()

Вывод:

enter image description here

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...