PyPI не допускает повторного использования имен файлов рассылки (имя проекта + номер версии + тип рассылки).
Это гарантирует, что данный дистрибутив для данного выпуска для данного проекта всегда будет разрешаться в один и тот же файл и не может быть тайно изменен один день сопровождающим проекта или злонамеренной стороной (его можно удалить только).
Вам нужно будет изменить номер версии на номер, который вы ранее не загружали в PyPI.
Вы не упомянули, как вы загружаете дистрибутив, но если вы используете шпагат, возможно, вы пытаетесь загрузить ранее загруженный дистрибутив. Чтобы решить эту проблему, вы можете сделать:
$ twine upload --skip-existing dist/*