Установка пакета Rgdal: projects.h: Нет такого файла или каталога (ошибка) - PullRequest
0 голосов
/ 25 апреля 2018

Я пытаюсь установить пакет Rgdal на свой локальный сервер (без подключения к Интернету).когда я запустил install.packages("rgdal_1.2-15.tar.gz","/usr/lib64/R/library/",repos=NULL) я получил ошибку inverser.c:4:22: error: projects.h: No such file or directory

это выход из процесса установки:

* installing *source* package ‘rgdal’ ...
** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -m64 -std=gnu99
configure: CXX: g++ -m64
configure: rgdal: 1.2-15
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 691
checking for gdal-config... /usr/bin/gdal-config
checking gdal-config usability... yes
configure: GDAL: 1.8.1
checking GDAL version >= 1.6.3... yes
checking gdal: linking with --libs only... yes
checking GDAL: /usr/share/gdal/pcs.csv readable... yes
configure: -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic -fpic -fPIC  -I/usr/include/gdal
checking proj_api.h presence and usability... yes
checking PROJ.4 version: ... 4.8.0
checking PROJ.4: epsg found and readable... yes
checking PROJ.4: conus found and readable... yes
configure: Package CPP flags:  -I/usr/include/gdal
configure: Package LIBS:  -lgdal -lproj
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
g++ -m64 -std=c++0x -I/usr/include/R -DNDEBUG -I/usr/include/gdal -I/usr/local/include -I"/usr/lib64/R/library/sp/include"   -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic -c OGR_write.cpp -o OGR_write.o
g++ -m64 -std=c++0x -I/usr/include/R -DNDEBUG -I/usr/include/gdal -I/usr/local/include -I"/usr/lib64/R/library/sp/include"   -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic -c gdal-bindings.cpp -o gdal-bindings.o
gcc -m64 -std=gnu99 -I/usr/include/R -DNDEBUG -I/usr/include/gdal -I/usr/local/include -I"/usr/lib64/R/library/sp/include"   -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic -fpic -fPIC   -c init.c -o init.o
gcc -m64 -std=gnu99 -I/usr/include/R -DNDEBUG -I/usr/include/gdal -I/usr/local/include -I"/usr/lib64/R/library/sp/include"   -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic -fpic -fPIC   -c inverser.c -o inverser.o
inverser.c:4:22: error: projects.h: No such file or directory
inverser.c:6: error: expected ‘)’ before ‘*’ token
make: *** [inverser.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘rgdal’
* removing ‘/usr/lib64/R/library/rgdal’
Warning message:
In install.packages("/data/ZUY10/Repo/R/rgdal_1.2-15.tar.gz", "/usr/lib64/R/library/",  :
  installation of package ‘/data/ZUY10/Repo/R/rgdal_1.2-15.tar.gz’ had non-zero exit status

Что я делал перед этим шагом:

Поскольку мой сервер является локальным, мне пришлось вручную установить все «зависимости» пакетов на локальном сервере, поэтому я установил вручную 30 пакетов, в которых PROJ.4 и Gdal являются основными, как вы можете видеть здесь .

Что мне здесь не хватает для установки RGDAL PACKAGE?

1 Ответ

0 голосов
/ 25 апреля 2018

Заголовок projects.h взят из PROJ.4. Где находится этот заголовочный файл в вашей системе? Вы можете передать это местоположение скрипту configure через --with-proj-include=DIR, т.е.

install.packages("rgdal_1.2-15.tar.gz",
                 "/usr/lib64/R/library/",
                 repos=NULL,
                 configure.args="--with-proj-include=DIR")

Проверка на наличие projects.h была добавлена ​​только к rgdal недавно .

...