Мне наконец-то удалось установить пакет. Я сделал следующее:
-УДАЛИТЬ предыдущие установки (я предполагал, что это будет сделано автоматически, но этого не произошло, и у меня была установлена более старая версия), набрав в Rstudio
remove.packages("fdaPDE")
-В Windows cmd, после загрузки кода с Github, введите
"Path/to/Rfolder/R" CMD BUILD <path to folder fdaPDE>
"Path/to/Rfolder/R" CMD INSTALL -l <path name of the R library tree> <path name of the package to be installed>
Надеюсь, что это может быть полезно для других людей, которые сталкиваются с подобными ошибками.