plot возвращает прерывистые линии (с пробелами) в R при использовании пакета очков

Question

ОБНОВЛЕНИЕ О РЕШЕНИИ:
установить пробелы аргумента = F в вашей команде plot ()
library(spectacles) spectra(your_data) <- sr_no ~ ... ~ 350:2500 # turn your data frame to Spectra* object with the spectrum range of your interest plot(your_data, gaps = F) # return plot with no gaps or line discontinuously

#

Мне нужно работать с объектом Spectra * и строить с кодом, похожим на этот, просто меняя встроенный фрейм данных "australia" на мои данные:

library(spectacles)    
data(australia)     
spectra(australia) <- sr_no ~ ... ~ 350:2500    
s <- cut(australia, wl =c(-1*450:500, -1*1800:2050))    
plot(s)    

Мой график в R вернулся с перерывами, как показано на рисунке ниже. Размер фрейма данных составляет 150 строк, 3156 столбцов. Проблема остается, когда я уменьшил df до 1800 столбцов.

У кого-нибудь были такие же проблемы? Не могли бы вы предложить решение? Огромное спасибо заранее!

Answer 1

Пожалуйста, потерпите меня, потому что визуально объяснить мой вопрос намного проще, чем оставить комментарий. Вы хотите удалить эти данные или вы хотите сократить часть данных? См. Примеры ниже.

s1 <- cut(australia, wl =c(-1*450:500, -1*1800:2050))
plot(s, gap=TRUE)

В качестве альтернативы вы можете использовать пример для файла справки в R.

library(ggplot)
data(australia)
spectra(australia) <- id ~ ... ~ 500:1800 # changed the range

r <- melt_spectra(australia)
australia$fact <- sample(LETTERS[1:3], size = nrow(australia), replace = TRUE)
r <- melt_spectra(australia, attr = 'fact')
p <- ggplot(r) + geom_line(aes(x=wl, y=nir, group=id, colour=fact)) + theme_bw()
print(p)

В качестве альтернативы вы можете взять часть анализа.

s <- as(cut(australia, wl = 1*450:550), 'Spectra') 
plot(s)