Ошибка rMATS "невозможно получить доступ к общей библиотеке" - PullRequest
Новая
       54

Ошибка rMATS "невозможно получить доступ к общей библиотеке"

0 голосов
/ 05 ноября 2018

Я пытаюсь запустить rMATS в кластере Linux (CentOS). На этой системе у меня нет root-доступа. Я установил несколько пакетов зависимостей rMATS с помощью менеджера пакетов anaconda conda install.

rMATS не может получить доступ к общей библиотеке libblas.so.3 в системе и выдает ошибку rMATSexe: error while loading shared libraries: libblas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

Хотя я обнаружил библиотеку libblas.so.3 в моей системе /Users/paul/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3 Я не уверен, как сделать ее доступной для программного обеспечения rMATS в качестве "общей библиотеки".

Я пытался export LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3, но это не сработало.

Где я могу поместить эту библиотеку libblas.so.3, чтобы она могла быть найдена системой?

1 Ответ

0 голосов
/ 05 ноября 2018

LD_LIBRARY_PATH - это путь к каталогу, а не путь к файлу. Вы хотите установить это так: 

LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib
...