Я пытаюсь использовать сценарий geneBody_coverage.py из RSeQC, для которого требуется разделенный...
Я новичок в R (и вообще кодирую) и действительно застрял в том, как решить эту проблему. У меня...
Я пытаюсь выполнить дифференциальную экспрессию гена в R, используя общедоступные данные RNA-seq
Я пытаюсь построить график подсчета на основе данных RNA-seq для отдельных генов. Меня интересуют...
Мне нужно проанализировать данные rna-seq, используя пакет airway в Rstudio, и мне нужно начать с...
У меня есть df из 17 переменных (мои образцы) с местоположением состояния, которое я хотел бы...
Я пытаюсь загрузить данные RNASeq из хранилища NCBI SRA, используя SRAdb package .Я последовательно...
Я пишу конвейер RNA-seq, используя Snakemake в течение недели. Я до сих пор не знаю рабочий порядок
Я пишу свой конвейер RNA-seq, используя Snakemake.Когда я писал последнюю часть rule fpkm, которая...
Я всегда получаю одно и то же сообщение об ошибке в моем конвейере RNAs-seq от snakemake:...
Я хочу использовать snakemake для написания моего конвейера RNA-seq, но он всегда сообщает об одних...
У меня есть количественная экспрессия гена Сальмона, которая дает мне транскрипты Ensembl, я...
Я пытаюсь выполнить метаанализ из разных наборов данных RNA-Seq, используя пакет metaRNASeq. Я...
Я выполняю RNA-seq в соответствии с https://bioinformatics.uconn.edu/rnaseq-arabidopsis/, следуя...
Я пишу сценарий, чтобы сравнить мои 50 образцов с другими 50 образцами, чтобы понять, насколько я...
У меня есть этот тиббл, сгенерированный функцией group_by в dplyr.Я хотел бы создать столбец...
Я использую сорго ID из фитозомы в моем RNAseq.Я хочу создать генную сеть с помощью cytoscape для...
Я молодой исследователь в области биоинформатики.Я определил некоторую lincRNA и теперь я хочу...
Я скачал файл матрицы данных выражений микроматрицы. ftp: //ftp.ncbi.nlm.nih
Моя версия Java: версия Java "1.8.0_201".Java (TM) SE Runtime Environment (сборка 1.8.0_201-b09)
Уважаемое сообщество переполнения стека: Я столкнулся с вопросом, когда проводил анализ RNA-seq с...
У меня есть культуры двух типов клеток (NOF и CAF) по отдельности, а также ко-культивировали с...
У меня проблема при запуске GSEA в командной строке: ошибка: 5290 [INFO ] Begun importing: Dataset...
У меня много последовательностей РНА одинаковой длины.Теперь я хочу создать функцию, которая выдаст...
Привет всем Я новичок в области системной биологии и биоинформатики.Мне были даны TEXT-файлы данных...