Я компилирую пакет R, содержащий .cpp исходные файлы от стороннего производителя. Для компиляции файлов .cpp в статическую библиотеку я использую файл Makevars.win ( ссылка ). Я наткнулся на странное поведение SHLIB только в Windows, пытаясь исправить еще одну проблему, связанную с параллельной make, которая показала, что у меня была неправильная скобка, определяющая $(SHLIB) как ($SHLIB) в Makevars и Makevars.win файлы ( ссылка ).
Короче говоря, я неправильно написал $(SHLIB) как ($SHILB) в моих Makevars и Makevars.win файлах. Исправление этой ошибки не дает мне ошибки на машинах Linux и OSX, но на Windows ($SHLIB) работает, но $(SHLIB) дает мне следующую ошибку:
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_bandpre_impl.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_bbdpre_impl.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_diag_impl.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_direct_impl.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_impl.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_spils_impl.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_bandpre.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_bbdpre.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_diag.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_direct.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_impl.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: cvode_spils.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: fnvector_serial.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: nvector_serial.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_band.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_config.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_dense.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_direct.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_fconfig.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_fnvector.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_iterative.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_linearsolver.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_math.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_matrix.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_nvector.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_pcg.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_sparse.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_spbcgs.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_spfgmr.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_spgmr.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_sptfqmr.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_types.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sundials_version.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: fsunlinsol_dense.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunlinsol_band.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunlinsol_dense.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunlinsol_pcg.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunlinsol_spbcgs.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunlinsol_spfgmr.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunlinsol_spgmr.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunlinsol_sptfqmr.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: fsunmatrix_dense.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: fsunmatrix_band.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunmatrix_band.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunmatrix_dense.h: File format not recognized
C:\Rtools\mingw_64\bin\nm.exe: sunmatrix_sparse.h: File format not recognized
c:/Rtools/mingw_64/bin/g++ -shared -s -static-libgcc -o sundialr.dll tmp.def cvode.o RcppExports.o -LC:/PROGRA~1/R/R-34~1.1/bin/x64 -lRlapack -LC:/PROGRA~1/R/R-34~1.1/bin/x64 -lRblas -lgfortran -lm -lquadmath -L../inst/ -lsundials_all -Ld:/Compiler/gcc-4.9.3/local330/lib/x64 -Ld:/Compiler/gcc-4.9.3/local330/lib -LC:/PROGRA~1/R/R-34~1.1/bin/x64 -lR
../inst//libsundials_all.a(cvode_bandpre.o):cvode_bandpre.c:(.text+0x679): undefined reference to `SUNBandLinearSolver'
../inst//libsundials_all.a(cvode_bandpre.o):cvode_bandpre.c:(.text+0x360): undefined reference to `SUNLinSolSetup_Band'
../inst//libsundials_all.a(cvode_bbdpre.o):cvode_bbdpre.c:(.text+0x819): undefined reference to `SUNBandLinearSolver'
../inst//libsundials_all.a(cvode_bbdpre.o):cvode_bbdpre.c:(.text+0x2ea): undefined reference to `SUNLinSolSetup_Band'
collect2.exe: error: ld returned 1 exit status
no DLL was created
ERROR: compilation failed for package 'sundialr'
Я понимаю, что сообщения об ошибках undefined reference связывают ошибки, но я не уверен, почему я получаю сообщения об ошибках File format not recognized для заголовочных файлов. Что еще интереснее, почему все работает нормально с заменой $(SHLIB) на ($SHLIB) в файле Makevars.win, когда в документе WRE говорится о $(SHLIB), а не ($SHLIB). Фактически, пакет прошел все проверки CRAN и до недавнего времени находился на CRAN с ($SHLIB) в Makevars.win.
Может ли кто-нибудь объяснить, почему это происходит, и как я могу исправить ошибки, которые я получаю с $(SHLIB) сейчас. Я хотел бы заменить ошибочный ($SHLIB) в моем коде. Спасибо!