Unity не поддерживает серверную часть сценариев .NET в пользу IL2CPP, и более новые версии автоматически выбирают IL2CPP в качестве серверной части сценариев. Вы по-прежнему можете запускать .NET в качестве серверной части сценариев на данный момент, но, возможно, было бы неплохо привыкнуть к серверной части сценариев IL2CPP, так как .NET в будущем будет удален. В 2018.2 есть управляемый отладчик для IL2PCPP, который должен позволить вам отлаживать ваш управляемый код (по сравнению с C ++, в который он конвертируется), но я пока не знаю об этом много.