Соответствующая вложенная структура случайных эффектов с использованием nlme (нелинейная модель смешанных эффектов) - PullRequest
0 голосов
/ 18 января 2019

Я надеюсь создать нелинейную модель со смешанным эффектом, используя пакет nlme.У меня есть три случайных эффекта: shoot вложен в tree, который вложен в site.У меня также есть три фиксированных эффекта: a0, b1 и b2

Это то, что я собрал:

fun_1 <- n ~ a0 * length^b1 * exp(b2 * age)

mm1 <-  nlme(fun_1, 
                data = branches_new_counts, 
                fixed = a0 + b1 + b2 ~ 1, 
                random = pdDiag(a0 + b1 + b2 ~ 1|dataset/tree/shoot_no),
                start = coef(fixed_model_final))  

Я уверен, что я указал случайныйнеправильно структурирует структуруЛюбые советы искренне приветствуются.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...