Консенсусная дендрограмма с использованием scipy - PullRequest
0 голосов
/ 11 ноября 2018

Я строю пять различных дендрограмм, используя библиотеку scipy.cluster.hierarchy (в частности, дендрограмму и связь), и теперь мне нужно сделать консенсусную дендрограмму, основанную на этих пяти дендрограммах, но я никуда не денусь.

Я думал о сохранении результата в другом формате, также используемом другими пакетами (например, формат newick, используемый в Biopython), но я изо всех сил пытаюсь преобразовать вывод scipy в эти форматы.

Кто-нибудь знает, как найти консенсусное дерево / дендрограмму / матрицу, используя Python?

Извините, я вроде как нуб, возможно, есть другие пакеты, которые я не могу найти, или что-то в этом роде.

Спасибо за вашу помощь!

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...