Я строю пять различных дендрограмм, используя библиотеку scipy.cluster.hierarchy
(в частности, дендрограмму и связь), и теперь мне нужно сделать консенсусную дендрограмму, основанную на этих пяти дендрограммах, но я никуда не денусь.
Я думал о сохранении результата в другом формате, также используемом другими пакетами (например, формат newick, используемый в Biopython), но я изо всех сил пытаюсь преобразовать вывод scipy в эти форматы.
Кто-нибудь знает, как найти консенсусное дерево / дендрограмму / матрицу, используя Python?
Извините, я вроде как нуб, возможно, есть другие пакеты, которые я не могу найти, или что-то в этом роде.
Спасибо за вашу помощь!