В списке Numberxpr перечислены поддерживаемые функции, и, увы, в нем нет функций Бесселя.
http://numexpr.readthedocs.io/projects/NumExpr3/en/latest/user_guide.html
Вы можете попробовать поискать альтернативные реализации, например, из GSL илибуст, но, честно говоря, я сомневаюсь, что разница в скорости будет нетривиальной, если вообще вообще есть.
Что может иметь отношение , так это избегание петель над точками на стороне питона.Либо просто используйте аргументы со значениями массива для scipy.special.kv
, либо перейдите на Cython и используйте версию cython_special
с цикличностью в Cython.