Как изменить метрику производительности с точности на точность, отзыв и другие метрики в приведенном ниже коде? - PullRequest
0 голосов
/ 01 февраля 2019

Будучи новичком в scikit-learn и пытаясь классифицировать набор данных радужной оболочки, у меня возникают проблемы с настройкой метрики оценки с scoring='accuracy' до , такие как точность, напомним, f1 и т. Д. На этапе перекрестной проверки.Ниже приведен полный пример кода ( достаточно, чтобы начать с # Test options and evaluation metric).

# Load libraries
import pandas
from pandas.plotting import scatter_matrix
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn import model_selection # for command model_selection.cross_val_score
from sklearn.metrics import classification_report
from sklearn.metrics import confusion_matrix
from sklearn.metrics import accuracy_score
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
from sklearn.discriminant_analysis import LinearDiscriminantAnalysis
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
from sklearn.svm import SVC



# Load dataset
url = "https://raw.githubusercontent.com/jbrownlee/Datasets/master/iris.csv"
names = ['sepal-length', 'sepal-width', 'petal-length', 'petal-width', 'class']
dataset = pandas.read_csv(url, names=names)


# Split-out validation dataset
array = dataset.values
X = array[:,0:4]
Y = array[:,4]
validation_size = 0.20
seed = 7
X_train, X_validation, Y_train, Y_validation = model_selection.train_test_split(X, Y, test_size=validation_size, random_state=seed)


# Test options and evaluation metric
seed = 7
scoring = 'accuracy'


#Below, we build and evaluate 6 different models
# Spot Check Algorithms
models = []
models.append(('LR', LogisticRegression()))
models.append(('LDA', LinearDiscriminantAnalysis()))
models.append(('KNN', KNeighborsClassifier()))
models.append(('CART', DecisionTreeClassifier()))
models.append(('NB', GaussianNB()))
models.append(('SVM', SVC()))


# evaluate each model in turn, we calculate the cv-scores, ther mean and std for each model
# 
results = []
names = []
for name, model in models:
    #below, we do k-fold cross-validation
    kfold = model_selection.KFold(n_splits=10, random_state=seed)
    cv_results = model_selection.cross_val_score(model, X_train, Y_train, cv=kfold, scoring=scoring)
    results.append(cv_results)
    names.append(name)
    msg = "%s: %f (%f)" % (name, cv_results.mean(), cv_results.std())
    print(msg)

Теперь, кроме скоринга = 'точности', я быхотел бы оценить другие показатели производительности для этой проблемы классификации мультикласса.Но когда я использую scoring = 'precision', он поднимает:

ValueError: Target is multiclass but average='binary'. Please choose another average setting.

Мои вопросы:

1) Я полагаю, вышеизложенное происходит потому, что точность'и' отзыв 'определены в scikit-learn только для бинарной классификации - это правильно?Если да, то какая команда (-ы) должна заменить scoring='accuracy' в приведенном выше коде?

2) Если я хочу вычислить матрицу путаницы, точность и вызов для каждого сгиба при выполнении пересечения k-сгибапроверка, какие команды я должен набрать?

3) Ради эксперимента я попытался набрать балл = 'balance_accuracy', только чтобы найти:

ValueError: 'balanced_accuracy' is not a valid scoring value.

Почему это происходит, когда документация по оценке модели (https://scikit -learn.org / stable / modules / model_evaluation.html ) ясно говорит, что сбалансированная точность является методом оценки ?Я здесь совсем запутался, поэтому будет полезен реальный код, показывающий, как оценивать другие характеристики производительности!Заранее спасибо!

1 Ответ

0 голосов
/ 01 февраля 2019

1) Полагаю, вышеизложенное происходит потому, что «точность» и «отзыв» определены в scikit-learn только для двоичной классификации - это правильно?

Нет.Точность и отзыв, безусловно, действительны и для многоклассовых задач - см. Документы для точность & отзыв .

Если да, то какая команда(s) должен заменить scoring = 'precision' в приведенном выше коде?

Проблема возникает из-за того, что, как вы можете видеть из приведенных выше ссылок на документацию, настройка по умолчанию для этих метрик предназначена длядвоичная классификация (average='binary').В случае мультиклассовой классификации вам необходимо указать, какая именно «версия» конкретной метрики вас интересует (их более одного);взгляните на соответствующую страницу документации scikit-learn, но некоторые допустимые опции для вашего параметра scoring могут быть:

'precision_macro'
'precision_micro'
'precision_weighted'
'recall_macro'
'recall_micro'
'recall_weighted'

Ссылка на документацию выше содержит даже примериспользования 'recall_macro' с данными радужной оболочки - обязательно проверьте его.

2) Если я хочу вычислить матрицу путаницы, выполните точность и вызов для каждого сгиба при выполнении перекрестной проверки k-кратностикакие команды я должен набрать?

Это не совсем тривиально, но вы можете увидеть путь в моем ответе за Метрики перекрестной проверки в scikit-learn для каждого разделения данных

3) Ради эксперимента я попытался набрать = сбалансированную оценку, только чтобы найти:

   ValueError: 'balanced_accuracy' is not a valid scoring value.

Это потому, что вы, вероятно, используете более старую версию scikit-learn.balanced_accuracy стало доступно только в v0.20 - вы можете убедиться, что недоступно в v0.18 .Обновите ваш scikit-learn до v0.20, и все будет в порядке.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...