Я работаю над Open Stats Lab для факториального ANOVA и опубликовал свой анализ на GitHub .
Как только у меня появилось значительное взаимодействие, как мне это сделать?Я провожу тест простых эффектов в R?
Смешанный дизайн разбалансирован следующим образом:
- фактор внутри объекта: Время 1, Время 2;
- фактор между субъектами: Условие 1 (обычное; n = 64), Условие 2 (необычное; n = 66).
Я импортировал данные и преобразовал их в длинный формат.
library(broom)
library(car)
library(nlme)
library(tidyverse)
> zhang_long[, 1:4]
# A tibble: 260 x 4
condition subject_id extra_time extra_rating
<fct> <fct> <fct> <dbl>
1 ordinary 1 t1_extra 1
2 ordinary 2 t1_extra 3
3 ordinary 3 t1_extra 1
4 ordinary 4 t1_extra 1
5 ordinary 5 t1_extra 5
6 ordinary 6 t1_extra 2
7 ordinary 7 t1_extra 2
8 ordinary 8 t1_extra 3
9 ordinary 9 t1_extra 4
10 ordinary 10 t1_extra 6
# ... with 250 more rows
Поскольку это практическое занятие, я могу проверить свои анализы на соответствие опубликованной статье.Мне удалось вычислить соответствующее F -значение, используя car::Anova
и nlme::lme
.
# Create linear mixed-effects model
extra_lme <- lme(extra_rating ~ condition*extra_time, random = ~1|subject_id,
data = zhang_long)
# Print ANOVA summary using type III sum of squares
options(contrasts = c("contr.sum", "contr.poly"))
Anova(extra_lme, type = "III")
Но теперь я застрял.Как мне провести тест простых эффектов для взаимодействия между временем и условием?
Я попытался поместить данные по условию.
# Split data by condition
ordinary <- zhang_long %>% filter(condition == "ordinary")
# Simple-effects test
Anova(lme(extra_rating ~ extra_time, random = ~1|subject_id, data = ordinary), type = "III")
Это очень приблизило меня к F -значение сообщается в документе, которое F (1, 128) = 39,86 .
Analysis of Deviance Table (Type III tests)
Response: extra_rating
Chisq Df Pr(>Chisq)
(Intercept) 610.25 1 < 2.2e-16 ***
extra_time 37.81 1 7.797e-10 ***
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
Что я делаю не так?
Я загрузил скрипт и документ Rmarkdown в GitHub .Любая помощь будет принята с благодарностью!