Столбцы Pheatmap и порядок строк после анализа кластеризации - PullRequest
Новая
       11

Столбцы Pheatmap и порядок строк после анализа кластеризации

0 голосов
/ 04 октября 2018

Я запускаю pheatmap и кластеризую столбцы и строки с cluster_rows = T и cluster_cols = T.Мне нужно извлечь векторы, сообщающие о новом порядке идентификаторов столбцов и строк.Сценарий ниже 

set.seed(123)
df<-data.frame( matrix(sample(30), ncol = 5))
colnames(df)<-LETTERS[1:5]
subj<-c("P1", "P2","P3", "T1", "T2","T3")
rownames(df)<-subj

library(pheatmap)
pheatmap(t(scale(df)), show_colnames = T, show_rownames = T, 
cluster_rows = T,  cluster_cols = T, legend = TRUE)
...