Дискриминантный анализ избыточности (RDA), расстояние Хеллингера и стандартизация - PullRequest
0 голосов
/ 16 февраля 2019

Я новичок в многовариантном анализе и знаю, что это скорее теоретический, чем практический вопрос, но чем больше я читаю, тем больше я теряюсь.И сейчас я не знаю, каким образом можно выполнить правильное RDA с использованием функции rda() из пакета vegan с моими данными.

С одной стороны, у меня есть изобилие рыбы из донного траланаучные исследования и, с другой стороны, у меня есть переменные среды, такие как температура дна, соленость,% органического вещества донных отложений, широта, долгота,….

Перед любым анализом я удалил виды с низкимпроцент случаев, а также я проверил данные об окружающей среде на предмет коллинеарности.

У меня есть следующее,

fishes_rda <- rda(abund_hell ~., data = environ_stand, scale = FALSE)

, где abund_hell - это преобразование Хеллингера численности рыб, а environment_stand - стандартизированная среда обитания.данные, но я не уверен, что выполняю правильную RDA.

Итак,

-Если я использую расстояние Хеллингера с матрицей обилия, мне не нужно стандартизировать данные об обилии перед применениемХеллингер, я?

- Принимая во внимание различные единицы и величины oДля данных об окружающей среде, я должен стандартизировать это?

Любая помощь будет очень приветствоваться.Спасибо

...