чтение XML-файла в R, созданное из устаревшей ошибки ImageJ: содержимое XML не похоже на XML - PullRequest
0 голосов
/ 10 октября 2018

Я использую пакет XML в Rstudio, чтобы попытаться импортировать следующий файл XML в R. Когда я использую любую из функций XML, я получаю следующий результат:

data <- xmlParse(file = "Cell_Counter_SJJ_094_01_2_Counting.xml")
Error: XML content does not seem to be XML: 
'Cell_Counter_SJJ_094_01_2_Counting.xml'

XML:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<CellCounter_Marker_File>
 <Image_Properties>
     <Image_Filename>SJJ_094_01_2_Counting.tif</Image_Filename>
 </Image_Properties>
 <Marker_Data>
     <Current_Type>2</Current_Type>
     <Marker_Type>
         <Type>1</Type>
         <Marker>
             <MarkerX>7172</MarkerX>
             <MarkerY>4332</MarkerY>
             <MarkerZ>1</MarkerZ>
         </Marker>
         <Marker>
             <MarkerX>7172</MarkerX>
             <MarkerY>4140</MarkerY>
             <MarkerZ>1</MarkerZ>
         </Marker>
         <Marker>
             <MarkerX>7186</MarkerX>
             <MarkerY>4072</MarkerY>
             <MarkerZ>1</MarkerZ>
         </Marker>
     </Marker_Type>
 </Marker_Data>
</CellCounter_Marker_File>

Есть идеи, почему он не читает его как файл XML?

...