Кажется, что ваши производные неявно определены некой линейной системой
A*dxdt = b
, которую вы пытаетесь решить с помощью итерации Гаусса-Зейделя.Это вы должны реализовать как итерацию, то есть несколько проходов по системе уравнений.Обратите внимание, что вам нужно условие сходимости, такое как диагональное доминирование, чтобы это работало вообще.
Но для этих небольших размеров вы можете быть быстрее и точнее, используя
dxdt = nump.linalg.solve(A,b)