Если вы храните BLOB-объекты, например изображения, не используйте tokudb. Он имеет меньший предел размера строки.
Если у вас есть данные, которые содержат более 100 миллионов строк, используйте tokudb.
Если вы чувствительны к скорости ОБНОВЛЕНИЯ, не используйте tokudb. Он имеет очень быструю вставку, но по сравнению с innodb, более медленную скорость обновления, особенно если вы используете операторы INSERT ON DUPLICATE.
Если вы храните записи журнала, используйте tokudb.
Если вы хотите сократить использование данных myisam / innnodb более чем в 5 раз, используйте tokudb. Я лично подтвердил, что их фрактальное дерево + бэкэнд данных сжатия чрезвычайно экономит место.
Правило большого пальца, используйте лучший инструмент для работы. Tokudb выдувает innodb и myisam из воды в определенных ситуациях, но это не обычный двигатель замены дб для всего, что находится под небом.