Miniconda / Qiime2 Ошибка плагина из-за разнообразия: неправильная форма на оси 0: 0 - PullRequest
0 голосов
/ 04 марта 2019

Я испытываю ошибку при использовании QIIME2 (2019.1) в среде Miniconda.Я следовал учебному пособию по движущимся изображениям со своими собственными данными, и все работало нормально, пока я не достиг шага core-metrics-метки.-table /Users/administrator/Desktop/skin3/filtered_table.qza –p-sampling-глубина 40000 –m-файл метаданных sample-metadata.tsv –output-dir core-metrics-results

Ошибка плагина изразнообразие:

Неверная форма на оси 0: 0.

Отладочная информация была сохранена в /var/folders/lh/ld9r0p7s3p357m6kcksvv4j00000gp/T/qiime2-q2cli-err-ds90x_md.log

Я уже попробовал опцию фильтра-вставки фрагмента qiime для очистки последовательностей из таблицы, которых нет в моем дереве, но я испытываю эту ошибку.Что это значит?

Проблемы, похоже, связаны с корневым деревом, поскольку я могу рассчитать разнообразие Шеннона с помощью table.qza и проверить файл метаданных на наличие ошибок.

Как я могупроверить мое корневое дерево на наличие ошибок?Этот файл .qza больше нельзя открыть в текстовом редакторе.На самом деле, в моем конвейере пока только один пример / последовательность - может ли это быть ошибкой?Действительно ли ось 0 находится в укорененном дереве или какой файл вызывает проблемы?

Заранее большое спасибо!

...