Попробуйте вместо этого:
august_report['Subsidy'] = np.where((august_report['Contract Renewal'] > 0)&(august_report['Transaction Types'].isnull()), '1','0')
или
august_report['Subsidy'] = np.where((august_report['Contract Renewal'] > 0)&(august_report['Transaction Types'] == ''), '1','0')
Ваш текущий код ищет 'NaN'
как строку, а не как пустое значение.