Ранее вы задавали еще один вопрос о проверке, и Ewout указал вам на доступный демонстрационный проект: https://github.com/FirelyTeam/Furore.Fhir.ValidationDemo
Если вы проверите код, вы обнаружите, что вы можете добавить другие преобразователи в настройки.ResourceResolver, который в вашем случае предположительно указывает только на базовую спецификацию.
Например, ищите эту строку:
var directorySource = new CachedResolver(new DirectorySource(profilePath, new DirectorySourceSettings { IncludeSubDirectories = true }));
Устанавливает преобразователь в папку, содержащую ваши пользовательские профили ирасширения и в следующей строке объединяет это с базовой спецификацией, которая будет использоваться в настройках валидатора.