Как создать файл .cdx из InChI с ChemDraw / Python? - PullRequest
Новая
       49

Как создать файл .cdx из InChI с ChemDraw / Python?

1 голос
/ 01 октября 2019

Я хотел бы создать файл ChemDraw .cdx из InChI с Python. Этот ответ дает решение для cdx --> InChI.

Минимальный пример ниже cdx_to_inchi работает нормально, но я не мог понять, как заставить inchi_to_cdx работать. 

import comtypes.client as w32

def cdx_to_inchi(cdx):
    ChemDraw = w32.CreateObject("ChemDraw.Application")
    ChemDraw.Visible = False
    Compound = ChemDraw.Documents.Open(cdx)            # opens existing file
    inchi = Compound.Objects.Data("chemical/x-inchi")
    print(inchi)
    ChemDraw.Quit()

def inchi_to_cdx(inchi):
    ChemDraw = w32.CreateObject("ChemDraw.Application")
    ChemDraw.Visible = False

    Compound = ChemDraw.Documents.Open("Emtpy.cdx")   # opens existing file
    # ChemDraw.Documents.New("NewFile.cdx")           # How to create a new file?

    # Compound.Objects.SetData(inchi)                 # How to paste InChi data?
    # ChemDraw.Documents.Save()                       # How to save?
    # ChemDraw.Documents.SaveAs("MyMolecule.cdx")     # How to save under different name?
    ChemDraw.Quit()

cdx = r'C:\Data\Test.cdx'
inchi = '1S/C6H6/c1-2-4-6-5-3-1/h1-6H'

cdx_to_inchi(cdx)
inchi_to_cdx(inchi)
...