Я пытаюсь построить филогенетическое дерево, используя ggtree в R.
library(ggplot2)
library(ggtree)
ggtree(rooted_phytree) + theme_tree2() + geom_tiplab(size=1.75)+ xlim(0,0.3) + geom_nodelab(size=1.75, hjust = 2, vjust = -0.3, color = 'blue')
rooted_phytree - лучшее дерево моделей, которое я получаю, используя RaxML после начальной загрузки. Приведенный выше код отображает, что дерево будет загружать все значения в виде меток узлов, а имена отдельных геномов - в качестве меток кончиков. Я хочу отобразить значение начальной загрузки только для тех узлов, для которых это значение превышает 70%.
Это можно было бы легко сделать с помощью функции подмножества, как предлагается в этом потоке .
Однако с ggplot2 эта функция больше не доступна. Так есть ли способ сделать это? Любая помощь с благодарностью.
Спасибо.