Какие статистические исследования следует проводить для анализа экспрессии генов, когда у меня есть кратные изменения данных генов - PullRequest
0 голосов
/ 17 октября 2019

Я новичок в R и анализе данных. Я работаю над экспрессией генов. Мой фрейм данных содержит Gene_ID и quantification_value, которые являются кратными изменениями гена. (значение представляет собой сумму, на которую ген изменен у любого затронутого человека по сравнению с незатронутым). Есть 87527 точек данных с 18422 уникальными генами. Я хочу выяснить, какие гены могут быть ключевым игроком для этой болезни. Какие статистические исследования возможны для этого типа проблемы. Помощь будет высоко оценена.

   Alzome_ID         Gene_ID         quantification_value
1 AZDRD8V2D0 ENSG00000136108               -3.688
2 AZDRD8V2D0 ENSG00000014641               -2.784
3 AZDRD8V2D0 ENSG00000281123               -2.782
4 AZDRD8V2D0 ENSG00000039537                -2.14
5 AZDRD8V2D0 ENSG00000063015               -1.822
6 AZDRD8V2D0 ENSG00000005421                -1.81

Я планирую сделать: 1. сортировку по количественному значению 2. частоту появления определенного гена в кадре данных 3. стандартное отклонение

...